git: почему все время "всплывают" игнорируемые файлы?

Question

В папке находится .gitignore с содержимым

*
!.gitignore

и тем не менее, git отслеживает изменения в этой папке. После того, как я выполняю

cd dir
git update-index --assume-unchanged $(git ls-files | tr '\n' ' ')

содержимое этой папки пропадает из git status, но периодически появляется снова: например, после создания новой ветки. Почему так происходит?